Le vaisseau USG Ishimura envoie un signal de détresse à la Concordance Extraction Corporation lors d’une opération minière sur la planète Aegis VII. Un autre vaisseau est envoyé pour enquêter sur les causes du signal ; cependant, alors qu’il tente de s’amarrer à l’Ishimura, il s’écrase dessus en raison d’un dysfonctionnement du système. L’équipage est attaqué par des monstres terrifiants.